Секвенатор Ion S5XL Ion Torrent, 3-80 млн.прочтений, производительность 0,6-15 млрд.п.н., анализ от 1 ч, Thermo Fisher Scientific

# A27214
по запросу
   

Простой и быстрый рабочий процесс для анализа панелей генов, микробных геномов, экзомов и транскриптомов.
  • Принцип работы  — полупроводниковое секвенирование — встраивание нуклеотидов полимеразой, с детекцией протонов (Н+) в полупроводниковом микрочипе;
  • не требует применения красителей, лазеров, фотодетекторов;
  • точность анализа, % — 99,9;
  • полученные результаты обсчитываются серверной станцией;
  • длина рида, п.н. — 200 или 400;
  • длительность запуска — 2,5 ч (при длине рида 200 п.н.), 4 ч (при длине рида 400 п.н.);
  • количество прочтений, млн.:
— Ion 520 — 3-5;
— Ion 530 — 15-18;
— Ion 540 — 60-80.
  • гибкая система чипов разной производительности, п.н.:
— Ion 520 — 0,6-1 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 1,2-2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);
— Ion 530 — 3-3,5 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 6-7,2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);
— Ion 540 — 10-15 млрд. (при длине рида 200 п.н.).
  • длительность анализа:
— Ion 520 — 1 ч (при длине рида 200 п.н.), 2 ч (при длине рида 400 п.н.);
— Ion 530 — 2,5 ч (при длине рида 200 п.н.), 4 ч (при длине рида 400 п.н.);
— Ion 540 — 5 ч (при длине рида 200 п.н.).
  • габариты, ШхГхВ, мм — 542×806×509;
  • вес нетто/ брутто, кг — 63,5/90,7.
Характеристики сервера:
  • конфигурация — отдельный стационарный компьютер в корпусе «tower», который поставляется вместе с системой Ion S5 XL;
  • ПО Torrent Suite со всеми необходимыми компонентами для обработки сигналов, определения последовательности оснований, выравнивания прочтений и определения мутаций;
  • процессор — E5-2680 v3 или лучше;
  • оперативная память — не менее 128 GB;
  • процессор GPU — NVIDIA K40;
  • хранение данных (приблизительтно) — доступно 28 TB;
  • операционная система — Система Ubuntu;
  • формат данных — стандартные форматы выходных данных FASTQ, SFF, BAM и VCF;
  • габариты, ШхГхВ, мм — 216×566×566;
  • вес, кг — 45.
Особенности:
  • менее 15 минут ручного труда для запуска секвенатора, менее 45 минут ручного труда для процедуры таргетного секвенирования от ДНК до результатов;
  • запуск секвенатора длится от 2,5 до 4 часов, от ДНК до результатов всего 24 часа;
  • небольшое количество стартового материала: 10 нг HK или РНК невысокого качества достаточно для получения полного списка мутаций или профиля экспрессии генов;
  • масштабируемость: один секвенатор для разнообразных экспериментальных задач, несколько форматов чипов для соответствия изменяющимся требованиям научных исследований.
Основные применения:
  • исследования рака: обнаружение химерных транскриптов в образцах тканей, исследование однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), инсерций и делеций, изменения числа копий генов (CNV), уровней экспрессии генов, используя 10 нг FFPE ДНК или РНК.
  • исследования наследственных заболеваний: изучение мутаций, связанных с метаболизмом лекарст, секвенирование больших и малых панелей генов, обнаружение SNP, инсерции и делеции, а также CNV, связанных с редкими или неизвестными болезнями, с помощью полноэкзомного секвенирования;
  • исследования инфекционных заболеваний: идентификация и генотипирование микроорганизмов с помощью полногеномного секвенирования, определение мутаций, ответственные за устойчивость к антибиотикам;
  • исследование анеуплоидий: высокопроизводительное определение анеуплоидий и числа копий генов.
Аксессуары и опции: панели AmliSeq, наборы реагентов, чипы для секвенирования Ion 520, Ion 530 и Ion 540.

Вспомогательное оборудование: станция пробоподготовки Ion Chef, станция пробоподготовки OneTouch 2, термоциклеры; микроцентрифуга для чипов, микроцентрифуги, центрифуги-вортексы, вортекс, флуориметр Qubit 3.0; гомогенизатор,  системы препаративного электрофореза, магнитные штативы, источник бесперебойного питания, твердотельные термостаты, мембранный насос, пипетки, штативы.


Комплект поставки, чипы, наборы. реагенты и расходные материалы — по запросу.

Выбрать панели AmliSeq >>>

Скачать материалы pdf:

Секвенаторы Ion S5 и S5XL, Thermo Fisher Scientific, брошюра, русск, 12 стр. >>>
Секвенаторы Ion S5 и S5XL, Thermo Fisher Scientific, листовка, русск, 2 стр. >>> 
Секвенаторы Ion S5 и S5XL, Thermo Fisher Scientific, спецификация, русск, 2 стр. >>> 
Система Ion Chef, Thermo Fisher Scientific, листовка, русск, 2 стр. >>> 
Система One Touch 2, Thermo Fisher Scientific, листовка, англ, 2 стр. >>> 
Компьютерная система Ion Reporter Server, Thermo Fisher Scientific, листовка, англ, 2 стр. >>>

Видео:

Технология Ion Torrent 




Секвенаторы Ion S5 и S5XL, рабочий процесс 

 

Секвенаторы Ion S5 и S5XL, сновные преимущества 




4478525
Магнитные частицы со стрептавидином Ion PGM Enrichment Beads для очистки и обогащения образца после эмульсионной ПЦР
по запросу
   

A27988
Калибровочный стандарт Ion S5 Calibration Standard, 8 реакций
по запросу
   

A27757
Набор реагентов Ion 520/530 Kit Chef для подготовки образца с помощью системы Ion Chef
по запросу
   

A27759
Набор реагентов Ion 540 Kit Chef для подготовки образца с помощью системы Ion Chef
по запросу
   

4468656
Набор Ion Sphere Quality Control для количественной оценки образца после эмульсионной ПЦР
по запросу
   

A27751
Набор реагентов Ion 520/530 Kit OT2 для подготовки образца с помощью системы OneTouch 2 и высокопроизводительного секвенирования
по запросу
   

A27753
Набор реагентов Ion 540 Kit OT2 для подготовки образца с помощью системы OneTouch 2 и высокопроизводительного секвенирования
по запросу
   

A27760
Набор реагентов Ion S5 Controls Kit для контроля качества подготовки образца к высокопроизводительному секвенированию
по запросу
   

A27762
Набор чипов Ion 520 Chip Kit для высокопроизводительного секвенирования, 3-5 млн. прочтений, 8 шт.
по запросу
   

A27764
Набор чипов Ion 530 Chip Kit для высокопроизводительного секвенирования, 15-20 млн. прочтений, 8 шт.
по запросу
   

A27766
Набор чипов Ion 540 Chip Kit для высокопроизводительного секвенирования, 60-80 млн. прочтений, 8 шт.
по запросу