Новые инструменты для создания геномных библиотек



В геномике широкое распространение получило использование геномных библиотек, применяемых для выделения, сохранения, идентификации и анализа фрагментов ДНК. Наиболее важной задачей при работе с геномными библиотеками представляется создание полного набора клонированных перекрывающихся фрагментов ДНК, полученных в результате рестрикции или механического расщепления тотальной ДНК, выделенной из какого-либо специфического источника.

Для ферментативного расщепления наиболее подходящими являются специфические частощепящие ферменты, например, Sau3AI или MboI (NEB), или неспецифические, такие как новый продукт: NEBNext dsDNA Fragmentase (NEB), дающий фрагменты длиной 100 - 800 п. н., также нашедший применение в NGS-секвенировании.

Для расщепления ДНК физическим методом перспективным является применение нового инструмента Q800R (QSonica), поскольку непрямой обработкой ультразвуком образцов очищенной ДНК или хроматина с подбором интенсивности и времени удается с большой точностью получать необходимый диапазон длин ДНК-фрагментов вплоть до 100 - 200 п. н. Возможна параллельная обработка до 24 проб в закрытых пробирках, исключающих кросс-контаминацию, с одновременным охлаждением для предотвращения перегрева.

При клонировании геномных библиотек в бактериальные клетки или вирусы, существенным подспорьем может быть новая полностью автоматизированная модульная система переноса колоний K2 (KBiosystems), позволяющая переносить до 3 тыс. колоний диаметром менее 0,5 мм в час, и распознающая любую посуду. Дополнительно, система может выполнять функцию гриддинга для прямого переноса геномных библиотек, или жидких образцов в многолуночные планшеты, или на поверхность мембран размером 22 х 22 см на заданном расстоянии с плотностью нанесения до 230 образцов на одну мембрану.

Клональная амплификация фрагментов ДНК, количественный анализ ДНК методом цифровой капельной ПЦР, анализ отдельных хромосом/клеток и многие другие задачи могут быть решены с использованием инновационной технологии микрофлюидики Dolomite, одним из применений которой является создание монодисперсных капель диаметром 5 - 200 мкм, в том числе двойных эмульсий “капля в капле”, заданного объема и химического состава. Разнообразие готовых стеклянных и кварцевых чипов и аксессуаров для быстрого подключения чипов к насосам и детекторам, а также возможность проектирования произвольной конфигурации каналов на чипах и разработки собственных интерфейсов обеспечивают беспрецедентную гибкость при разработке и внедрении новых методов исследований.

Информация для заказа:
Развернуть описание # _Dolomite
 Dolomite Microfluidics
по запросу